More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3941 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27233  normal  0.241063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.4 
 
 
278 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  51.87 
 
 
305 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  49.05 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1299  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.03 
 
 
303 aa  235  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.987107  normal  0.450444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18290  chromosome partitioning ATPase  51.95 
 
 
255 aa  231  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1882  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.92 
 
 
254 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0348907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.64 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1545  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.73 
 
 
278 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0482678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3091  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.8 
 
 
256 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124174  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4883  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.08 
 
 
258 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4176  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.25 
 
 
256 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  30.61 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  33.08 
 
 
257 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4190  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
274 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 
294 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
259 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.32 
 
 
257 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 
255 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.05 
 
 
266 aa  105  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  29.39 
 
 
348 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.18 
 
 
259 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.9 
 
 
256 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.31 
 
 
256 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  30.08 
 
 
268 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.42 
 
 
256 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  29.13 
 
 
251 aa  102  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  30.42 
 
 
256 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  31.42 
 
 
259 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.89 
 
 
265 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  29.88 
 
 
254 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1796  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.82 
 
 
268 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.8 
 
 
259 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.08 
 
 
276 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4710  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
263 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  27.65 
 
 
258 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  31.91 
 
 
256 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.92 
 
 
255 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.37 
 
 
260 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.42 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  28.79 
 
 
284 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.05 
 
 
257 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.42 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.42 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 
304 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.5 
 
 
261 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.5 
 
 
261 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.31 
 
 
253 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  31.49 
 
 
262 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  34.06 
 
 
261 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  31.06 
 
 
262 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
256 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.18 
 
 
270 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.83 
 
 
261 aa  99  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4295  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
265 aa  99  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.12 
 
 
253 aa  99  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
253 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.15 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.15 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  33.77 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  30.15 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.15 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  30.8 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  34.21 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.15 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  31.45 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  31.49 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.15 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.15 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  27.82 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  30.71 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  29.1 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.1 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.1 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.96 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.96 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  30.96 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  32.03 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  31.49 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.96 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.96 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  27.31 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.96 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.96 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.05 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.96 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  30.64 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.64 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.64 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  30.11 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.13 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  30.61 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  26.35 
 
 
257 aa  96.3  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.8 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>