107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0647 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0647  chromate transporter  100 
 
 
178 aa  344  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  33.33 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.62 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  32.3 
 
 
379 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.65 
 
 
379 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.65 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  31.97 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  31.29 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  31.29 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  31.25 
 
 
376 aa  67.8  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  30.61 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  30.61 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  30.61 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  32.91 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  31.91 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  31.47 
 
 
392 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  30.56 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  30.82 
 
 
420 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  28 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.55 
 
 
382 aa  61.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  30.77 
 
 
397 aa  60.8  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.07 
 
 
392 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  31.48 
 
 
382 aa  60.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  29.93 
 
 
390 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  30.67 
 
 
389 aa  58.9  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  29.25 
 
 
376 aa  58.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  29.63 
 
 
378 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  31.34 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32 
 
 
390 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32 
 
 
390 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  27.03 
 
 
390 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  27.03 
 
 
390 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  28.65 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  27.86 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  27.03 
 
 
390 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  29.32 
 
 
394 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  27.86 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.69 
 
 
199 aa  54.7  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  27.86 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  27.86 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  27.86 
 
 
175 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  30.4 
 
 
401 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  30.07 
 
 
385 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  33.58 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.15 
 
 
392 aa  51.6  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  32.8 
 
 
401 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.85 
 
 
391 aa  51.6  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.3 
 
 
386 aa  51.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  25.49 
 
 
174 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  26.43 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  26.43 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  30.36 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  28.91 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.11 
 
 
472 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  26.54 
 
 
383 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  24.66 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  31.25 
 
 
399 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  42.19 
 
 
401 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  27.14 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  28.48 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  28.47 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  31.01 
 
 
208 aa  48.5  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  27.52 
 
 
416 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  28.19 
 
 
177 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  30.61 
 
 
200 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  28.77 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  28.05 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.62 
 
 
472 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  24.32 
 
 
182 aa  47  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  26.32 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3495  Chromate transporter  28.57 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  26.85 
 
 
172 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2840  Chromate transporter  32.88 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  26.72 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  26.49 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  25.76 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  22.38 
 
 
173 aa  44.7  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2220  chromate transport protein, putative  26.28 
 
 
402 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2539  chromate transporter  26.28 
 
 
397 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2075  chromate transporter  26.28 
 
 
397 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.231578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  26.43 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1310  chromate transport protein, putative  26.28 
 
 
397 aa  44.3  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1150  chromate transporter  26.28 
 
 
397 aa  44.3  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1159  chromate transporter  26.28 
 
 
397 aa  44.3  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.725557  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  27.35 
 
 
398 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  31.21 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0705  chromate transporter  26.28 
 
 
422 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  26.32 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  26.53 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  31.76 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  26.4 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  27.78 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  26.4 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  26.4 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  26.4 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  26.4 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  26.4 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.68 
 
 
415 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  24.46 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>