More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0551 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
266 aa  520  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7196  sulfate ester transporter permease protein  51.65 
 
 
261 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4841  ABC transporter permease  52.38 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22530  ABC transporter inner-membrane protein  49.38 
 
 
257 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
266 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.534527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2063  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  46.28 
 
 
273 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2158  sulfate ester ABC transporter inner membrane protein  44.72 
 
 
292 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0339108  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0132  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  44.53 
 
 
293 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404079  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
290 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
271 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
271 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.811587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1910  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.81 
 
 
270 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.75 
 
 
271 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334186  hitchhiker  0.000427033 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
299 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0237  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  38.06 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
258 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
536 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 
532 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
275 aa  171  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0265  ABC transporter permease  47.84 
 
 
538 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02340  putative permease of ABC transporter  46.98 
 
 
538 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00529429  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
533 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 
528 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
564 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
538 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
537 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.300396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
286 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
534 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.02 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  34.02 
 
 
279 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  34.23 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
528 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08100  ABC transporter, permease component  44.1 
 
 
528 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.34 
 
 
282 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  36.21 
 
 
282 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
254 aa  141  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
281 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.96 
 
 
532 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.76 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
268 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  35.89 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
309 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal  0.61218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
286 aa  138  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  35.48 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
262 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
286 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.961582  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.16 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
272 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
566 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0913088  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0236  ABC sulfate ester transporter, inner membrane subunit  37 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00657173  hitchhiker  0.00236959 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.266674  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
264 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
284 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.47 
 
 
263 aa  131  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22520  ABC transporter inner-membrane protein  36.61 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4842  putative ABC transporter (permease protein)  37.08 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2159  sulfate ester ABC transporter inner membrane protein  37.32 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514359  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2062  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  35 
 
 
280 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.332807  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
302 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  39.36 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
272 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5468  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  36.29 
 
 
284 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
281 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  33.47 
 
 
293 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
253 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
283 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
273 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
277 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
253 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  33.62 
 
 
282 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
265 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
283 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1867  ABC transporter permease  35.29 
 
 
272 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  33.62 
 
 
282 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  33.6 
 
 
262 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2919  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
282 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35916e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2959  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  33.47 
 
 
284 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.132224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
297 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
264 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
289 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
289 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753313  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>