259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0158 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 
291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  83.04 
 
 
295 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  75 
 
 
291 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  74.65 
 
 
291 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  73.26 
 
 
291 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  73.26 
 
 
291 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  68.75 
 
 
291 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7534  5'-methylthioadenosine phosphorylase  75 
 
 
291 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  69.1 
 
 
291 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  72.92 
 
 
291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  69.44 
 
 
301 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  69.44 
 
 
291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  67.01 
 
 
291 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  61.09 
 
 
297 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.39 
 
 
290 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.04 
 
 
290 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.04 
 
 
290 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.15 
 
 
295 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  56.6 
 
 
297 aa  334  7.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  56.1 
 
 
289 aa  331  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  56.29 
 
 
294 aa  329  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  55.75 
 
 
305 aa  326  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  55.63 
 
 
289 aa  325  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  54.33 
 
 
290 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  55.67 
 
 
290 aa  311  9e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  50.85 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  49.31 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  49.12 
 
 
292 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.24 
 
 
291 aa  263  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  47.22 
 
 
287 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  50.73 
 
 
302 aa  262  6e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  47.24 
 
 
290 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  47.87 
 
 
286 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.76 
 
 
290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  48.76 
 
 
287 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  46.55 
 
 
290 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  46.55 
 
 
290 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  46.53 
 
 
287 aa  254  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50.21 
 
 
290 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  47.2 
 
 
303 aa  252  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  44.56 
 
 
284 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  46.55 
 
 
290 aa  247  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  47.22 
 
 
288 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  45.83 
 
 
287 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  44.1 
 
 
287 aa  245  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  44.79 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  47.71 
 
 
286 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2582  methylthioadenosine phosphorylase  47.46 
 
 
275 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  45.77 
 
 
298 aa  241  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  44.41 
 
 
294 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  43.94 
 
 
294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  48.09 
 
 
296 aa  237  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  43.36 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  44.52 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.36 
 
 
316 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  46.47 
 
 
298 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.94 
 
 
304 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  44.62 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  42.09 
 
 
303 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.09 
 
 
310 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.3 
 
 
297 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  44.36 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  42.7 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  42.21 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  43.37 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.62 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3476  methylthioadenosine phosphorylase  39.58 
 
 
301 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  45.2 
 
 
269 aa  208  9e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03341  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.21 
 
 
299 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  43.27 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01530  glutamate biosynthesis-related protein, putative  42.25 
 
 
303 aa  199  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  40.41 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  39.93 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  40.41 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  40.41 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  41.04 
 
 
257 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  43.98 
 
 
264 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  40.17 
 
 
249 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65182  predicted protein  42.26 
 
 
332 aa  189  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.306629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  39.33 
 
 
279 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10230  5'-methylthioadenosine phosphorylase (Meu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08720)  41.67 
 
 
355 aa  187  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0600587  normal  0.0456068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.13 
 
 
267 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  41.63 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  40.87 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  47.12 
 
 
268 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  40.87 
 
 
280 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  37.65 
 
 
268 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  39.22 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  39.59 
 
 
257 aa  178  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.37 
 
 
263 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  40.24 
 
 
280 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  40.3 
 
 
263 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.74 
 
 
258 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.74 
 
 
258 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  37.76 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.34 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.84 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  42.69 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  41.04 
 
 
264 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.26 
 
 
263 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>