More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31670 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 353 aa  725    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  38.19 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  38.81 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  37.7 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  34.26 
 
 		 349 aa  212  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  36.34 
 
 		 351 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  36.44 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  36.36 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  36.34 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  36.16 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  36.16 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  36.16 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  36.16 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  38.16 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  35.73 
 
 		 362 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  32.22 
 
 		 359 aa  205  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  32.22 
 
 		 359 aa  205  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  35.47 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  35.21 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  34.37 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 		 359 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  33.8 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.17 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  33.81 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  35.22 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  32.84 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  34.67 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  33.06 
 
 		 377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.83 
 
 		 371 aa  162  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  33.79 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  33.79 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.22 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 374 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 356 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 369 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  27.5 
 
 		 438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.11 
 
 		 387 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  30.66 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 		 333 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 		 376 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  32.77 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  29.02 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  29.78 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 337 aa  122  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  29.64 
 
 		 366 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 363 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  36.57 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  36.57 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  36.49 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 359 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.34 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  31.77 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.17 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.23 
 
 		 388 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.61 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  27.55 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.07 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.37 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.02 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.21 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>