216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20350  glycerate kinase  100 
 
 		 383 aa  716    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0440  Glycerate kinase  44.87 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  45.28 
 
 		 375 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  42.78 
 
 		 409 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  43.44 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  39.41 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  44.82 
 
 		 377 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  41.84 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0243  glycerate kinase  46.81 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  40.33 
 
 		 379 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08140  glycerate kinase  43.3 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14280  glycerate kinase  46.63 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000570843  normal  0.0813973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  35.91 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  40.17 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1595  glycerate kinase  39.19 
 
 		 376 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  41.55 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1476  glycerate kinase  49.58 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  36.06 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  38.86 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  38.86 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  40.82 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  35.97 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  44.3 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  35.39 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  42.98 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  35.39 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  35.39 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  35.39 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  38.59 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  35.39 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  35.39 
 
 		 408 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  35.39 
 
 		 381 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  35.39 
 
 		 408 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  35.39 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  40.82 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  41.24 
 
 		 395 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  40 
 
 		 380 aa  205  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  44.84 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  45.77 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  38.27 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  42.77 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  43.6 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  41.32 
 
 		 398 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  37.6 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  43.28 
 
 		 394 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  41.55 
 
 		 381 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  37.73 
 
 		 381 aa  203  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  36.12 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  43.14 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  40 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  41.64 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  41.29 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0956  glycerate kinase  44.2 
 
 		 373 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.421654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  35.83 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  36.97 
 
 		 377 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  35.83 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  35.83 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  35.83 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  36.68 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2327  glycerate kinase  45.78 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118083  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  42.74 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  38.81 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  35.77 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  42.74 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  36.12 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  36.83 
 
 		 392 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  36.41 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  42.47 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  36.41 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  36.1 
 
 		 384 aa  196  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  39.39 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  36.41 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  40.33 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  40.64 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  36.15 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  38.01 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  36.39 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  35.41 
 
 		 386 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  36.11 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  37.57 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  37.06 
 
 		 379 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  35.5 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  44.73 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  34.42 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  35.48 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  34.69 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  37.15 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0572  glycerate kinase  39.58 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0411866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1010  glycerate kinase  46.08 
 
 		 363 aa  187  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4727  glycerate kinase  50.66 
 
 		 511 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2484  glycerate kinase 1  48.18 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  35.26 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  35.26 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2368  glycerate kinase  48.18 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  33.93 
 
 		 402 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  38.87 
 
 		 379 aa  185  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  40.16 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1468  glycerate kinase 1  48.18 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5226  glycerate kinase  45.54 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  37.15 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>