124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18740 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  100 
 
 		 181 aa  351  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.86 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  36.9 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.94 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  39.53 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  39.05 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  36.05 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  38.46 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  37.13 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  39.18 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  38.86 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.9 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  32.75 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  32.16 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  31.36 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.73 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.86 
 
 		 175 aa  91.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  35.63 
 
 		 385 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  32.73 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.93 
 
 		 165 aa  87.8  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.73 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  33.14 
 
 		 172 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.54 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.7 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.3 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2819  amino acid-binding ACT domain protein  31.52 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1537  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.52 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1532  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.52 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0236669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1565  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.52 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  31.52 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2735  ACT domain-containing protein  31.52 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02738  hypothetical protein  27.75 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1722  ACT domain-containing protein  31.52 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  30.91 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003104  glycine cleavage system regulatory protein  27.75 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00303201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.48 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1407  ACT domain-containing protein  29.52 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.222833  normal  0.039362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0869  hypothetical protein  27.17 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00598997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.82 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2585  amino acid-binding ACT  28.48 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.6 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  34.53 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.88 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  26.14 
 
 		 1319 aa  64.7  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  30.06 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.31 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1791  amino acid-binding ACT domain protein  28.41 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000108735  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2553  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.41 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000108497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2668  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.41 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000549184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.08 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.41 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  26.97 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.39 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.11 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  27.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  27.65 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  27.37 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  34.33 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.48 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2413  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.27 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204037  hitchhiker  0.00509125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1878  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.27 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.87 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1701  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.27 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0560544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2341  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.27 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1655  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.27 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2546  hypothetical protein  24.68 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  30.71 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.81 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2884  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  24.71 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  33.78 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  29.48 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  27.01 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.49 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.92 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.78 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.33 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  27.71 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.98 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  37.84 
 
 		 404 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.56 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  23.98 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  27.68 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  32.43 
 
 		 90 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  28.49 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  27.54 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.64 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3675  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  24.22 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002792  glycine cleavage system transcriptional antiactivator GcvR  29.6 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  34.48 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3629  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  19.16 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.68 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  36.49 
 
 		 415 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  36.49 
 
 		 404 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  36.49 
 
 		 404 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.85 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.85 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.85 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.85 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.85 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  23.35 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>