More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  100 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  71.75 
 
 		 311 aa  418  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  72.4 
 
 		 311 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  74.03 
 
 		 311 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  71.1 
 
 		 311 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  72.73 
 
 		 311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  70.23 
 
 		 309 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0952  cysteine synthase  69.81 
 
 		 311 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.820864  normal  0.859633 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  66.34 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  64.08 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  65.02 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  62.26 
 
 		 310 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  61.29 
 
 		 310 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  61.31 
 
 		 328 aa  356  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  62.9 
 
 		 311 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  61.44 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  58.69 
 
 		 311 aa  352  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  59.15 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  60.7 
 
 		 319 aa  345  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  56.33 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  55.12 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  57.98 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  55.12 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  57.47 
 
 		 320 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  58.69 
 
 		 327 aa  341  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  60.65 
 
 		 310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  61.24 
 
 		 322 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  61.44 
 
 		 320 aa  338  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  58.52 
 
 		 313 aa  338  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  57.88 
 
 		 320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  58.36 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  58.06 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  60.53 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  58.17 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  60.66 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 309 aa  335  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  57.43 
 
 		 308 aa  335  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  58.44 
 
 		 320 aa  335  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  56.03 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  52.94 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  56.25 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  57.7 
 
 		 327 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  63.28 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  59.61 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  59.15 
 
 		 331 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  60.46 
 
 		 320 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  59.42 
 
 		 320 aa  331  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  56.68 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  61.64 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  57.65 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  52.58 
 
 		 312 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  56.39 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  55.88 
 
 		 327 aa  328  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  55.56 
 
 		 311 aa  328  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  62.3 
 
 		 332 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  57.38 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  56.55 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  55.02 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  58.09 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  59.35 
 
 		 321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  56.72 
 
 		 305 aa  326  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  59.41 
 
 		 309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  55.34 
 
 		 311 aa  325  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  57.38 
 
 		 319 aa  325  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  55.26 
 
 		 309 aa  325  9e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  56.07 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  56.77 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  55.74 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  55.92 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  57 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  59.15 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  59.48 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  56.35 
 
 		 311 aa  322  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  56.68 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  55.12 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  56.39 
 
 		 325 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  52.81 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  52.13 
 
 		 304 aa  321  8e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  56.59 
 
 		 317 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  56.35 
 
 		 309 aa  320  9.999999999999999e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  56.17 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  52.46 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 326 aa  319  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 326 aa  319  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  58.69 
 
 		 322 aa  319  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  56.27 
 
 		 323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  54.69 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  55.74 
 
 		 317 aa  319  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  54.69 
 
 		 322 aa  318  6e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  51.79 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1773  cysteine synthases  56.39 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  59.48 
 
 		 327 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 320 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  54.22 
 
 		 322 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  54.4 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  56.03 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  57.65 
 
 		 311 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  51.8 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>