92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1495 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1495  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  333  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301949  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4448  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  92.73 
 
 
173 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3920  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  92.73 
 
 
174 aa  307  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5859  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  90.91 
 
 
173 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284913  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4341  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  87.35 
 
 
173 aa  294  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3880  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  86.75 
 
 
176 aa  293  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745877  normal  0.0848334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5754  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.19 
 
 
163 aa  201  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.036925  hitchhiker  0.00000000000572699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1404  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  47.37 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.812752  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.75 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1873  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  47.37 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1845  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.37 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.900726  normal  0.129019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01744  hypothetical protein  47.37 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01756  hypothetical protein  47.37 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2511  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  47.37 
 
 
167 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.579279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1855  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.37 
 
 
167 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.157643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2041  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  46.71 
 
 
167 aa  136  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1821  YbaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  37.63 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2011  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  46.05 
 
 
167 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.111031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2074  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  43.95 
 
 
175 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1894  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  43.59 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1408  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  43.59 
 
 
175 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1374  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  43.59 
 
 
175 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.734452  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1391  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  42.95 
 
 
175 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000245761 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1112  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.16 
 
 
191 aa  118  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-like protein  37.97 
 
 
162 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.702018  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  35.71 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  33.1 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2116  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.11 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0022261  decreased coverage  0.00203199 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0933  hypothetical cytosolic protein  28 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2082  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.14 
 
 
154 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.81 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1914  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.61 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  28.93 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  30.58 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  30.58 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2156  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.95 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.284719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  26.49 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1756  hypothetical protein  28.48 
 
 
152 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  52  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  52  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 
159 aa  52  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  28.38 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  50.8  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  29.49 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.57 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2070  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.57 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0237486  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1929  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.18 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  30.89 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0303  hypothetical protein  28.1 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000014956  unclonable  0.000000628456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0168  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.28 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1260  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.17 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.78 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  28.1 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  28 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  30.7 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  24.65 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  24.65 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1215  hypothetical protein  25.33 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  24.65 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.49 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2911  hypothetical protein  25.69 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121231  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.34 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  24.65 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  26.32 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1758  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.29 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  30.99 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  28.95 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  23.53 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  23.53 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  23.24 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  23.18 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5493  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.81 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.317787  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  24.48 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5904  hypothetical protein  25.4 
 
 
157 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.515734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  31.19 
 
 
170 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  29.7 
 
 
154 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  29.22 
 
 
156 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  26.62 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0201  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.35 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387657  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.65 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3621  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.64 
 
 
199 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  27.56 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1541  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.92 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  27.27 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0089  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  20.53 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  24.5 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>