More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1125 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  99.63 
 
 		 268 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  99.63 
 
 		 268 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  95.15 
 
 		 268 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  94.78 
 
 		 268 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  94.78 
 
 		 268 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  90.67 
 
 		 268 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  75.1 
 
 		 275 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  75.5 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  75.5 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  75.5 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  75.5 
 
 		 273 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  75.5 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  75.5 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  75.5 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  73.06 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  72.29 
 
 		 263 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  71.26 
 
 		 270 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  68.8 
 
 		 268 aa  362  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  70.85 
 
 		 263 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  69.88 
 
 		 263 aa  361  8e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  67.74 
 
 		 265 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  68.02 
 
 		 258 aa  355  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  69.64 
 
 		 263 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  69.23 
 
 		 263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  67.5 
 
 		 261 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  67.92 
 
 		 261 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  66.4 
 
 		 261 aa  349  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  65.99 
 
 		 261 aa  344  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  65.99 
 
 		 261 aa  344  7e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  65.99 
 
 		 261 aa  344  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  65.99 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  65.99 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  63.75 
 
 		 258 aa  338  5e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  63.82 
 
 		 260 aa  335  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  63.35 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  61.79 
 
 		 258 aa  332  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  59.46 
 
 		 261 aa  331  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  59.06 
 
 		 260 aa  329  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  59.46 
 
 		 261 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  62.35 
 
 		 284 aa  328  7e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  58.14 
 
 		 260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  63.11 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  58.53 
 
 		 260 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  58.53 
 
 		 260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  58.53 
 
 		 260 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  61.02 
 
 		 267 aa  325  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  58.53 
 
 		 260 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  61.81 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  61.51 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  57.75 
 
 		 260 aa  321  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  58.87 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  58.3 
 
 		 261 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  61.42 
 
 		 269 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  57.26 
 
 		 256 aa  318  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  60.24 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 		 271 aa  315  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  59.77 
 
 		 274 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  61.02 
 
 		 271 aa  314  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  58.49 
 
 		 284 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  59.43 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  60.24 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  60.16 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  58.94 
 
 		 264 aa  311  7.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  57.84 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  57.84 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  57.72 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  59.04 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 		 271 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  57.72 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  59.45 
 
 		 271 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 		 266 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  59.11 
 
 		 258 aa  308  6.999999999999999e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  59.11 
 
 		 270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  59.06 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  58.66 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 		 274 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  56.97 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  57.32 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  55.69 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  56.97 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1820  methionine aminopeptidase, type I  58.59 
 
 		 277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  54.88 
 
 		 260 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  58.87 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  58.82 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  55.73 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  54.44 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  58.33 
 
 		 271 aa  299  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  58.33 
 
 		 271 aa  299  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  57.14 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  56.28 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  56.28 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>