40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4198 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  67.74 
 
 
608 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  99.83 
 
 
595 aa  1192    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1192    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  46.82 
 
 
658 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  46.82 
 
 
658 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  46.82 
 
 
658 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  46.66 
 
 
1533 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  46.52 
 
 
662 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  46.89 
 
 
707 aa  485  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  44.12 
 
 
618 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  44.08 
 
 
618 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  46.37 
 
 
636 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  44.12 
 
 
618 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  35.49 
 
 
605 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  34.16 
 
 
634 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  32.82 
 
 
614 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.99 
 
 
631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  29.66 
 
 
615 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  32.61 
 
 
592 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  29.27 
 
 
636 aa  165  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
1103 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  26.68 
 
 
1103 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  25.78 
 
 
592 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  22.59 
 
 
585 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  27.31 
 
 
588 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  26.7 
 
 
596 aa  80.1  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  34.64 
 
 
290 aa  76.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  30.51 
 
 
893 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  36.44 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  26.16 
 
 
638 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  28.57 
 
 
334 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  26.75 
 
 
638 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  21.27 
 
 
597 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
256 aa  52.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  31.16 
 
 
295 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.78 
 
 
292 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3188  hypothetical protein  34.31 
 
 
295 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.56 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.57 
 
 
259 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
280 aa  43.5  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>