90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1201 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  58.82 
 
 		 648 aa  749    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  95.56 
 
 		 652 aa  1258    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  100 
 
 		 678 aa  1394    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  67.37 
 
 		 651 aa  876    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  64.95 
 
 		 678 aa  851    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  82.87 
 
 		 653 aa  1090    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  83.79 
 
 		 653 aa  1117    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  84.25 
 
 		 653 aa  1123    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  100 
 
 		 678 aa  1394    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  68.23 
 
 		 662 aa  925    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  84.4 
 
 		 653 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  78.26 
 
 		 650 aa  1068    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  83.79 
 
 		 653 aa  1117    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  62.44 
 
 		 688 aa  785    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  84.4 
 
 		 653 aa  1129    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  65.94 
 
 		 631 aa  870    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  96.63 
 
 		 654 aa  1307    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  72.95 
 
 		 630 aa  917    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  66.21 
 
 		 650 aa  874    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  84.4 
 
 		 653 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  93.88 
 
 		 653 aa  1259    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  69.49 
 
 		 673 aa  913    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  99.08 
 
 		 654 aa  1335    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  95.25 
 
 		 651 aa  1288    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  83.79 
 
 		 653 aa  1117    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  78.73 
 
 		 650 aa  1076    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  43.99 
 
 		 623 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7168  putative exported alkaline phosphatase  69.62 
 
 		 253 aa  325  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  35.42 
 
 		 583 aa  313  9e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  37 
 
 		 630 aa  271  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  31.29 
 
 		 607 aa  268  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  40.61 
 
 		 625 aa  260  6e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  27.27 
 
 		 626 aa  141  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  30 
 
 		 631 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  30.07 
 
 		 624 aa  138  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  27.59 
 
 		 612 aa  124  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  25.16 
 
 		 883 aa  72.8  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  24.5 
 
 		 884 aa  67.4  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  25.71 
 
 		 887 aa  67  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  24.52 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  28.01 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  23.84 
 
 		 695 aa  59.7  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  23.29 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  27.35 
 
 		 689 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  32.05 
 
 		 632 aa  55.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  28.17 
 
 		 638 aa  55.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  22.44 
 
 		 681 aa  54.3  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  22.7 
 
 		 593 aa  54.3  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  28.24 
 
 		 698 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  22.77 
 
 		 593 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  26.4 
 
 		 689 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  24.68 
 
 		 663 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  25.21 
 
 		 659 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  25.45 
 
 		 663 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  25.21 
 
 		 659 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 		 596 aa  52.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  25.74 
 
 		 658 aa  51.6  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  26.77 
 
 		 821 aa  51.6  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  23.93 
 
 		 690 aa  51.2  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  30.6 
 
 		 689 aa  50.8  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  25.79 
 
 		 715 aa  50.8  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  31.03 
 
 		 739 aa  50.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  24.65 
 
 		 718 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  22.57 
 
 		 667 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  23.65 
 
 		 638 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  23.97 
 
 		 699 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  23.97 
 
 		 699 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  22.81 
 
 		 699 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  27.03 
 
 		 383 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  24.51 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3179  protein of unknown function DUF839  28.82 
 
 		 818 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  28.05 
 
 		 587 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  24.9 
 
 		 680 aa  48.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  27.27 
 
 		 662 aa  47.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  23.32 
 
 		 704 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  27.1 
 
 		 494 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  25.99 
 
 		 458 aa  47  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  27.16 
 
 		 738 aa  46.6  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  21.95 
 
 		 639 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  26.5 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  27.27 
 
 		 629 aa  45.8  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0331  twin-arginine translocation pathway signal  24.26 
 
 		 733 aa  45.8  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  24.9 
 
 		 726 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  26.67 
 
 		 786 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  25.64 
 
 		 383 aa  44.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  23.31 
 
 		 560 aa  44.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  25 
 
 		 389 aa  44.3  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  24.38 
 
 		 669 aa  44.3  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  24.04 
 
 		 708 aa  44.3  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  26.03 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>