More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0667 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  44.96 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  48.89 
 
 		 148 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  35.2 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.55 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 131 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.28 
 
 		 135 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 146 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  36.57 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  41.28 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  35.29 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 133 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 130 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.53 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.53 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 150 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 134 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  41.44 
 
 		 132 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  36.52 
 
 		 148 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 140 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.665763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 128 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.61 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.61 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 146 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 126 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  35.85 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  34.97 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.58 
 
 		 136 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  40.19 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  34.84 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  35.85 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  33.91 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.25 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.71 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.71 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.71 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.71 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.71 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  37.14 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  35.51 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  34.48 
 
 		 124 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 129 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 137 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 125 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 142 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  29.37 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  29.37 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  35.45 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  29.01 
 
 		 145 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>