37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0532 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  302  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.12 
 
 
320 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.12 
 
 
320 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.12 
 
 
320 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  48.48 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  41.32 
 
 
594 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  39.13 
 
 
218 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  43.06 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  39.73 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  37.4 
 
 
236 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  39.25 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  42.86 
 
 
228 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  47.3 
 
 
105 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  35.71 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0271  hypothetical protein  37.31 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  40 
 
 
185 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  40 
 
 
185 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  35.21 
 
 
198 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  41.74 
 
 
235 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  53.33 
 
 
254 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  33.8 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  41.13 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  37.14 
 
 
161 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  38.46 
 
 
172 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  36.71 
 
 
249 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.5 
 
 
438 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2227  hypothetical protein  36 
 
 
322 aa  44.3  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  37.14 
 
 
521 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2057  hypothetical protein  38.16 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  33.33 
 
 
484 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2142  hypothetical protein  38.16 
 
 
102 aa  40.8  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  41.56 
 
 
888 aa  40.8  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3589  hypothetical protein  38.98 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793233  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0722  hypothetical protein  42.11 
 
 
209 aa  40.8  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  33.71 
 
 
209 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>