50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0298 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  46.67 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2050  anti-sigma-factor antagonist  45.45 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  47.37 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.48 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.47 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  34.74 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  27.47 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  26.37 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  36.47 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1305  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427492  decreased coverage  0.000306808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  43.08 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3141  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.129085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3637  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2967  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3797  anti-sigma-factor antagonist  38.16 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  27.71 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  28.97 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  31.17 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.72 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 116 aa  40  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  24.44 
 
 		 109 aa  40  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>