38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5233 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  62.68 
 
 		 142 aa  186  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  62.68 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  43.09 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  38.13 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  40.35 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  42.35 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  39.01 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  36.64 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  45.56 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  36.24 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  37.07 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  35.38 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  33.56 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  30.08 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  33.99 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  27.66 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  38.37 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  27.13 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  29.66 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  30.17 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  33.73 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  31.3 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  36.17 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  30.67 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  25.81 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  31.76 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  34.44 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  25.42 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  31.76 
 
 		 150 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>