37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3885 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3885  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1486  AraC family transcriptional regulator  87.18 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.193369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4267  AraC family transcriptional regulator  84.38 
 
 		 333 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0242  AraC family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 355 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 332 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 334 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 334 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 339 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3315  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 281 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  hitchhiker  0.00000399067 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 334 aa  42  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 356 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 		 330 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 330 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5513  putative AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 348 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 334 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 334 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  62.5 
 
 		 372 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 346 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 334 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 346 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 350 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  68 
 
 		 359 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  56.67 
 
 		 342 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  58.06 
 
 		 352 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0092  AraC family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0112  AraC family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1518  AraC family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1236  AraC family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0077  AraC family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 330 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 361 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 382 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  68 
 
 		 360 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  45.95 
 
 		 348 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  60 
 
 		 330 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1576  AraC family transcription regulator  54.84 
 
 		 205 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 375 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>