More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2068 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.59 
 
 		 634 aa  673    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.58 
 
 		 637 aa  701    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  53.58 
 
 		 637 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  53.58 
 
 		 637 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  53.65 
 
 		 636 aa  668    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  53.81 
 
 		 637 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  53.27 
 
 		 638 aa  676    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 		 636 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  89.32 
 
 		 646 aa  1100    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  89.16 
 
 		 646 aa  1096    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.67 
 
 		 637 aa  699    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 		 676 aa  885    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.52 
 
 		 635 aa  708    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  70.81 
 
 		 692 aa  889    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.58 
 
 		 637 aa  702    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  54.67 
 
 		 637 aa  668    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  52.89 
 
 		 676 aa  663    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  54.67 
 
 		 651 aa  656    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  54.05 
 
 		 636 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  53.43 
 
 		 636 aa  645    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  52.84 
 
 		 659 aa  662    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  89.16 
 
 		 646 aa  1096    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  53.65 
 
 		 637 aa  668    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  52.11 
 
 		 636 aa  656    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 635 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  54.98 
 
 		 636 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 		 643 aa  667    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  51.4 
 
 		 635 aa  636    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 		 635 aa  714    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  71.23 
 
 		 643 aa  905    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 635 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  89.16 
 
 		 646 aa  1100    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  55.54 
 
 		 636 aa  653    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  53.74 
 
 		 636 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 		 635 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  52.91 
 
 		 636 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  95.8 
 
 		 643 aa  1148    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  56.23 
 
 		 638 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2078  ABC transporter-related protein  53.88 
 
 		 654 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  52.65 
 
 		 639 aa  672    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  53.81 
 
 		 637 aa  670    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0581  ABC transporter related  56.09 
 
 		 647 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2071  ABC transporter related  55.24 
 
 		 656 aa  692    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  54.32 
 
 		 656 aa  691    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  89.16 
 
 		 646 aa  1096    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1802  putative ATP-binding ABC transporter protein  53.33 
 
 		 660 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  51.34 
 
 		 673 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1937  ABC transporter related  99.36 
 
 		 628 aa  1152    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.832952 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  87.77 
 
 		 646 aa  1092    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 635 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  98.13 
 
 		 643 aa  1290    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  53.55 
 
 		 656 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.12 
 
 		 640 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  52.72 
 
 		 636 aa  666    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  53.89 
 
 		 636 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  82.33 
 
 		 650 aa  1062    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  53.43 
 
 		 633 aa  680    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1992  ABC transporter related  50.73 
 
 		 678 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  82.04 
 
 		 657 aa  1069    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  51.72 
 
 		 638 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  53.89 
 
 		 650 aa  665    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  53.12 
 
 		 657 aa  653    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1808  ABC transporter related  50.88 
 
 		 672 aa  655    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.762366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  55.76 
 
 		 633 aa  660    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.12 
 
 		 640 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  89.16 
 
 		 646 aa  1096    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 635 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  72.74 
 
 		 640 aa  924    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1759  ABC transporter-related protein  57.76 
 
 		 554 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656937  normal  0.0503302 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.12 
 
 		 640 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  70.19 
 
 		 645 aa  888    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.8 
 
 		 637 aa  683    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  98.13 
 
 		 643 aa  1290    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  53.17 
 
 		 650 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.58 
 
 		 637 aa  701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 		 637 aa  703    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.52 
 
 		 639 aa  687    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  54.83 
 
 		 635 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  54.67 
 
 		 637 aa  676    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  54.67 
 
 		 637 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  53.67 
 
 		 636 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3608  ABC transporter related  50.44 
 
 		 687 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100909  normal  0.0123712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  53.81 
 
 		 637 aa  670    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  100 
 
 		 643 aa  1313    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  53.58 
 
 		 637 aa  701    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.68 
 
 		 638 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  98.13 
 
 		 643 aa  1290    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.58 
 
 		 637 aa  701    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  55 
 
 		 637 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  89.32 
 
 		 646 aa  1099    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.58 
 
 		 637 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  94.71 
 
 		 643 aa  1162    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  86.22 
 
 		 646 aa  1090    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  51.75 
 
 		 651 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03980  ABC transporter ATP-binding protein  52.93 
 
 		 650 aa  632  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2351  ABC transpoter ATPase  53.44 
 
 		 650 aa  630  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  51.95 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2715  ABC transporter related  51.22 
 
 		 650 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  52.17 
 
 		 672 aa  628  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  52.92 
 
 		 642 aa  620  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>