45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2014 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  91.3 
 
 		 81 aa  133  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  84.81 
 
 		 80 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  92.65 
 
 		 80 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  85.9 
 
 		 81 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  83.33 
 
 		 81 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  91.04 
 
 		 81 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  89.55 
 
 		 78 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  88.06 
 
 		 74 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  86.76 
 
 		 81 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  86.76 
 
 		 81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  86.57 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  74.07 
 
 		 91 aa  124  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  73.81 
 
 		 89 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  85.07 
 
 		 80 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  84.85 
 
 		 80 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  82.61 
 
 		 81 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  86.67 
 
 		 86 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  50.79 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  46.03 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  46.05 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  49.23 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  48.44 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  49.23 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  49.23 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  49.23 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  46.97 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  42.42 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  45.59 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  42.42 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  46.15 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  46.03 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  44.62 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  44.62 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  41.54 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  35.94 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  41.54 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  42.42 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  42.65 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  38.98 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  43.08 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>