32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4372 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  71.74 
 
 		 92 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  90.16 
 
 		 61 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  60.23 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  60 
 
 		 100 aa  110  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  57.95 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0926  CopG family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3354  CopG family transcriptional regulator  57.3 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.010277  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2575  CopG family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.888914  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  46.59 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  46.59 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  47.67 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  45.78 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1216  hypothetical protein  34.09 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.676541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0112  hypothetical protein  34.09 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0584  hypothetical protein  31.87 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00104491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  31.82 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  31.46 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0805  hypothetical protein  30.68 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  35.71 
 
 		 256 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  51.16 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5941  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  40 
 
 		 1345 aa  43.9  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2811  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  41.3 
 
 		 1361 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1541  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  37.5 
 
 		 1320 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  42.86 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2904  CopG family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000144196  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3496  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.43 
 
 		 1323 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>