35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1249 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 121 aa  256  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  47.13 
 
 		 92 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  45.88 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3354  CopG family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.010277  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  39.77 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  37.36 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  36.84 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1216  hypothetical protein  46.84 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.676541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0112  hypothetical protein  45.57 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0805  hypothetical protein  45.57 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0926  CopG family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  44.3 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2575  CopG family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.888914  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  31.87 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  44.83 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  37.89 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0584  hypothetical protein  33.71 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00104491  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0022  CopG family protein  28.41 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0698  CopG family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0592094  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0092  CopG family protein  28.41 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0262945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3496  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.13 
 
 		 1323 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3171  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.13 
 
 		 1326 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3301  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.13 
 
 		 1325 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.584307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2208  CopG family transcriptional regulator  25 
 
 		 90 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.901295  normal  0.042561 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0149  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  42.22 
 
 		 1325 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4017  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  40.48 
 
 		 1322 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3489  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.53 
 
 		 1320 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.376631  normal  0.245835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4209  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  40.48 
 
 		 1322 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>