26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1692 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  95.74 
 
 		 94 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  94.68 
 
 		 94 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  94.68 
 
 		 94 aa  178  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  94.38 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  61.8 
 
 		 92 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  54.02 
 
 		 90 aa  103  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3354  CopG family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.010277  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  50 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  52.22 
 
 		 96 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0926  CopG family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 92 aa  94.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  49.46 
 
 		 96 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2575  CopG family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 97 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.888914  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  46.74 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  45.05 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  59.02 
 
 		 61 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1216  hypothetical protein  36.67 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.676541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0112  hypothetical protein  36.67 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0805  hypothetical protein  35.56 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2904  CopG family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000144196  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  37.35 
 
 		 256 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0584  hypothetical protein  28.74 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00104491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>