30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2607 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  47.37 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  46.05 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  41.33 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  44.16 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  42.47 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0580  CopG family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  36.49 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  34.38 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2538  hypothetical protein  36.07 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  36.84 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  36.84 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  40 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3081  transcriptional regulator, CopG family  31.08 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  35.29 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2331  CopG-like DNA-binding  37.5 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.695826  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0086  hypothetical protein  37.5 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 102 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  34.15 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0584  hypothetical protein  30 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00104491  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0255  hypothetical protein  36.99 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50052  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>