25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1179 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 86 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  53.01 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  40 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  34.67 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  40.91 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1125  CopG family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000121555  unclonable  0.00000692901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4874  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62267  hitchhiker  0.00867489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4792  transcriptional regulator, CopG family  36.11 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0479  CopG family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  37.68 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2331  CopG-like DNA-binding  30.38 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.695826  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  41.79 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  36.21 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  36.21 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  30 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  35.71 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  35.71 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  37.5 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  43.86 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  30.36 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>