24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3519 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 82 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  44 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3081  transcriptional regulator, CopG family  51.35 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  40.85 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  39.13 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  40 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2538  hypothetical protein  32.43 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4780  CopG family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 80 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00236164  hitchhiker  0.00756111 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  38.46 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 89 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0086  hypothetical protein  32.88 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  30.14 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  32.31 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  30.14 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0580  CopG family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  30.3 
 
 		 89 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5345  transcriptional regulator, CopG family  37.68 
 
 		 86 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.459849 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  41.3 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0479  CopG family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>