20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1117 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  69.51 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  39.71 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  34.67 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  37.14 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  35.94 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  35.94 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  33.33 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  30.99 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0580  CopG family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  33.77 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  32.31 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  48.94 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6450  CopG family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158963  normal  0.302139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0698  CopG family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0592094  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  50 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>