24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0479 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0479  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4874  AraC family transcriptional regulator  78.05 
 
 		 82 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62267  hitchhiker  0.00867489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4792  transcriptional regulator, CopG family  80.77 
 
 		 82 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0698  CopG family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0592094  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1682  transcriptional regulator, CopG family  40.51 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172973  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6450  CopG family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158963  normal  0.302139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4743  transcriptional regulator, CopG family  75 
 
 		 40 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0586661 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5345  transcriptional regulator, CopG family  42.11 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.459849 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5961  CopG family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4448  transcriptional regulator, CopG family  40.51 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00107538  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5045  transcriptional regulator, CopG family  40.51 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1736  transcriptional regulator, CopG family  40.51 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.814149  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4338  transcriptional regulator, CopG family  40.51 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34669  normal  0.37145 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5065  transcriptional regulator, CopG family  39.47 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2208  CopG family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.901295  normal  0.042561 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0022  CopG family protein  38.67 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0092  CopG family protein  38.67 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0262945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  37.68 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  35.29 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4780  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00236164  hitchhiker  0.00756111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  32.43 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0036  transcriptional regulator, CopG family  31.65 
 
 		 90 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>