17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0145 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  69.51 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  44.78 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  40 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  35.38 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  40.58 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  40 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0580  CopG family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  39.71 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0479  CopG family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4874  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62267  hitchhiker  0.00867489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4792  transcriptional regulator, CopG family  40.58 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>