25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2452 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 81 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  95.06 
 
 		 81 aa  157  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  57.53 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  48.57 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  40 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3081  transcriptional regulator, CopG family  34.57 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0185  hypothetical protein  63.04 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  49.09 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4780  CopG family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00236164  hitchhiker  0.00756111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2538  hypothetical protein  35.21 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  38.81 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  38.81 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  37.5 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  33.33 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0580  CopG family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  35.71 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1965  CopG-like DNA-binding  45.95 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0374946  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  43.24 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  51.35 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>