25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3676 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  57.53 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  58.21 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  47.95 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  40.85 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3081  transcriptional regulator, CopG family  37.66 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  38.67 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0185  hypothetical protein  55.32 
 
 		 52 aa  52.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  40.91 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2538  hypothetical protein  38.03 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  33.78 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  32.84 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  32.84 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  33.77 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  54.05 
 
 		 74 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  51.35 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2434  CopG domain protein DNA-binding domain protein  46.34 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0086  hypothetical protein  32.43 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.311004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>