21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1569 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  100 
 
 		 73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  66.2 
 
 		 74 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  61.97 
 
 		 74 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4391  helix-turn-helix protein, CopG  60.56 
 
 		 74 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  60.61 
 
 		 74 aa  87.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0379  CopG domain-containing protein DNA-binding domain-containing protein  56.34 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1339  CopG domain protein DNA-binding domain protein  53.52 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1377  CopG family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2095  CopG domain protein DNA-binding domain protein  52.11 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3232  hypothetical protein  55.56 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.706269  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2403  CopG domain protein DNA-binding domain protein  44.23 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10640  hypothetical protein  36.62 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1616  CopG/DNA-binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000428775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1291  anti-toxin protein  40.58 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1260  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0599  helix-turn-helix protein, CopG  40.91 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1337  CopG-like DNA-binding protein  39.44 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000429607 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  40.58 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1965  CopG-like DNA-binding  40.82 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0374946  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  51.35 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>