25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1626 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  100 
 
 		 74 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  70.83 
 
 		 74 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  67.57 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  66.2 
 
 		 73 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4391  helix-turn-helix protein, CopG  70.83 
 
 		 74 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1339  CopG domain protein DNA-binding domain protein  62.16 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1377  CopG family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 74 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2095  CopG domain protein DNA-binding domain protein  60.81 
 
 		 82 aa  90.1  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0379  CopG domain-containing protein DNA-binding domain-containing protein  62.16 
 
 		 70 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3232  hypothetical protein  56.72 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.706269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1616  CopG/DNA-binding domain-containing protein  51.39 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000428775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  48.57 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1260  CopG/DNA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1291  anti-toxin protein  44.44 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0599  helix-turn-helix protein, CopG  44.44 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2403  CopG domain protein DNA-binding domain protein  51.72 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10640  hypothetical protein  39.19 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1337  CopG-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000429607 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1965  CopG-like DNA-binding  44.9 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0374946  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0470  CopG domain protein DNA-binding domain protein  30.99 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000198456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0194  toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  34.72 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  51.35 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  51.35 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  43.86 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>