23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1339 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1339  CopG domain protein DNA-binding domain protein  100 
 
 		 82 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2095  CopG domain protein DNA-binding domain protein  90.24 
 
 		 82 aa  149  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1377  CopG family transcriptional regulator  98.65 
 
 		 74 aa  144  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  62.16 
 
 		 74 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0379  CopG domain-containing protein DNA-binding domain-containing protein  58.11 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  52.7 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3232  hypothetical protein  59.7 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.706269  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4391  helix-turn-helix protein, CopG  48.65 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  50 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  53.52 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1260  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.05 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1291  anti-toxin protein  46.05 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1616  CopG/DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000428775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0599  helix-turn-helix protein, CopG  45.83 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  42.86 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0194  toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  39.19 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2403  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.92 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10640  hypothetical protein  35.14 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1238  hypothetical protein  31.51 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000000115747  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1360  hypothetical protein  31.51 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.937532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1965  CopG-like DNA-binding  36.36 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0374946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1337  CopG-like DNA-binding protein  35.62 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000429607 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1482  hypothetical protein  30.43 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>