16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2403 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011061  Paes_2403  CopG domain protein DNA-binding domain protein  100 
 
 		 73 aa  150  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  51.72 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4391  helix-turn-helix protein, CopG  53.33 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0379  CopG domain-containing protein DNA-binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3232  hypothetical protein  52 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.706269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  44.23 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1339  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.92 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  43.48 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  47.83 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2095  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.83 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1377  CopG family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1616  CopG/DNA-binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000428775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1291  anti-toxin protein  50 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1260  CopG/DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0599  helix-turn-helix protein, CopG  43.18 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>