20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4391 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009036  Sbal_4391  helix-turn-helix protein, CopG  100 
 
 		 74 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  70.83 
 
 		 74 aa  97.1  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  68.18 
 
 		 74 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  60.56 
 
 		 73 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  54.05 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2095  CopG domain protein DNA-binding domain protein  50 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1339  CopG domain protein DNA-binding domain protein  48.65 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1291  anti-toxin protein  50 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1260  CopG/DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1377  CopG family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1616  CopG/DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000428775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3232  hypothetical protein  54.93 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.706269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0379  CopG domain-containing protein DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0599  helix-turn-helix protein, CopG  44.44 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  43.06 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2403  CopG domain protein DNA-binding domain protein  53.33 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10640  hypothetical protein  35.14 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1965  CopG-like DNA-binding  45.45 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0374946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7187  hypothetical protein  32.14 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000770139  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1337  CopG-like DNA-binding protein  35.14 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000429607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>