19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0599 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0599  helix-turn-helix protein, CopG  100 
 
 		 75 aa  150  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1616  CopG/DNA-binding domain-containing protein  69.33 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000428775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1291  anti-toxin protein  62.67 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1260  CopG/DNA-binding domain-containing protein  62.67 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3232  hypothetical protein  51.43 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.706269  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4391  helix-turn-helix protein, CopG  44.44 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1339  CopG domain protein DNA-binding domain protein  45.83 
 
 		 82 aa  67  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1377  CopG family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2095  CopG domain protein DNA-binding domain protein  43.06 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  44.44 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  46.48 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  40.54 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7187  hypothetical protein  40.58 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000770139  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0379  CopG domain-containing protein DNA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  41.67 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  40.91 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0325  helix-turn-helix protein, CopG  36.11 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0194  toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  33.78 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2403  CopG domain protein DNA-binding domain protein  43.18 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>