22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0445 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  100 
 
 		 80 aa  164  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  44 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  47.95 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  48.57 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  53.33 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3081  transcriptional regulator, CopG family  42.47 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  37.1 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  37.14 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  34.29 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  36.67 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  36.67 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2538  hypothetical protein  32.43 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0185  hypothetical protein  43.48 
 
 		 52 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4780  CopG family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00236164  hitchhiker  0.00756111 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  30.36 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>