26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03468 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 82 aa  163  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  49.09 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  49.09 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4780  CopG family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00236164  hitchhiker  0.00756111 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0580  CopG family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  28.95 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  38.46 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  30.88 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  33.78 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  34.29 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2538  hypothetical protein  34.33 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  32 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  52.5 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  30 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  44.68 
 
 		 118 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3081  transcriptional regulator, CopG family  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  43.9 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>