26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2499 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3354  CopG family transcriptional regulator  76.4 
 
 		 90 aa  146  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.010277  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  60.92 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0926  CopG family transcriptional regulator  55.06 
 
 		 92 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  54.02 
 
 		 94 aa  103  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  50.57 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  47.13 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2575  CopG family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.888914  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  42.05 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  45.88 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  55 
 
 		 61 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1216  hypothetical protein  39.44 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.676541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  34.52 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  38.57 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0112  hypothetical protein  36.62 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0805  hypothetical protein  37.14 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  37.35 
 
 		 256 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2811  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  47.62 
 
 		 1361 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5345  transcriptional regulator, CopG family  31.17 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.459849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  43.9 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>