25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3557 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  167  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  48.61 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 79 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  45.71 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  45.71 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  44.74 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  43.24 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  40.62 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  35 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  43.94 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4780  CopG family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00236164  hitchhiker  0.00756111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2538  hypothetical protein  36.84 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  34.52 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3081  transcriptional regulator, CopG family  32.39 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0086  hypothetical protein  35.71 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  30.99 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1125  CopG family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000121555  unclonable  0.00000692901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2331  CopG-like DNA-binding  33.33 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.695826  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6060  hypothetical protein  29.58 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>