21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1116 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  170  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  56.41 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  45.57 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  44.44 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1125  CopG family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000121555  unclonable  0.00000692901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  37.14 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  40.32 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  31.88 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  38.71 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  38.89 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  28.99 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  28.99 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0479  CopG family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4874  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62267  hitchhiker  0.00867489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2331  CopG-like DNA-binding  29.11 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.695826  normal  0.278417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>