27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6360 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  71.74 
 
 		 92 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3354  CopG family transcriptional regulator  67.05 
 
 		 90 aa  126  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.010277  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  65.17 
 
 		 94 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  65.17 
 
 		 94 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  60.92 
 
 		 90 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  61.8 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0926  CopG family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  75.41 
 
 		 61 aa  99.4  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  50 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2575  CopG family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 97 aa  93.6  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.888914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  50 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  47.13 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  40.45 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1216  hypothetical protein  32.95 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.676541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0112  hypothetical protein  32.95 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  31.82 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0805  hypothetical protein  34.62 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  30.34 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2904  CopG family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000144196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0584  hypothetical protein  31.4 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00104491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  34.83 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  52.5 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2811  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.13 
 
 		 1361 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>