26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1445 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 102 aa  206  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 94 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  98.88 
 
 		 94 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  95.51 
 
 		 94 aa  169  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  94.38 
 
 		 94 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  64.29 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  56.25 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3354  CopG family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.010277  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  56.63 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0926  CopG family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2575  CopG family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.888914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  52.27 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  47.06 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  50.63 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  64.15 
 
 		 61 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1216  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.676541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0112  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0805  hypothetical protein  38.75 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  36.99 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  36.84 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2904  CopG family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000144196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0584  hypothetical protein  31.65 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00104491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  42.47 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 79 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>