26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1769 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  96.81 
 
 		 94 aa  184  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  95.74 
 
 		 94 aa  183  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  94.68 
 
 		 94 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  95.51 
 
 		 102 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  64.04 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  60.23 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  55.17 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3354  CopG family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.010277  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  54.44 
 
 		 96 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0926  CopG family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 92 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  51.61 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2575  CopG family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.888914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  48.35 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  47.83 
 
 		 96 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  62.3 
 
 		 61 aa  83.6  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0112  hypothetical protein  38.89 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1216  hypothetical protein  38.89 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.676541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0805  hypothetical protein  37.78 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  36.26 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  36.67 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2904  CopG family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000144196  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  38.89 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0584  hypothetical protein  30.85 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00104491  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0580  CopG family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  0.646408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>