24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0584 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0584  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  186  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00104491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0698  CopG family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0592094  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4443  hypothetical protein  54.76 
 
 		 56 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714201 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  31.4 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0092  CopG family protein  35.71 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0262945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0022  CopG family protein  35.71 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  33.71 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2208  CopG family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.901295  normal  0.042561 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6450  CopG family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158963  normal  0.302139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1682  transcriptional regulator, CopG family  34.52 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172973  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5345  transcriptional regulator, CopG family  33.33 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.459849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5065  transcriptional regulator, CopG family  32.14 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4275  hypothetical protein  26.19 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  36.84 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5961  CopG family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2904  CopG family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 94 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000144196  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  30 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>