21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6450 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6450  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158963  normal  0.302139 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5961  CopG family transcriptional regulator  94.19 
 
 		 86 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5065  transcriptional regulator, CopG family  87.06 
 
 		 86 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5345  transcriptional regulator, CopG family  85.88 
 
 		 86 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.459849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1682  transcriptional regulator, CopG family  76.74 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172973  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0092  CopG family protein  75.9 
 
 		 94 aa  135  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0262945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0022  CopG family protein  75.9 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4448  transcriptional regulator, CopG family  80.49 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00107538  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5045  transcriptional regulator, CopG family  80.49 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4338  transcriptional regulator, CopG family  80.49 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34669  normal  0.37145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1736  transcriptional regulator, CopG family  80.49 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.814149  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0698  CopG family transcriptional regulator  72.62 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0592094  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2208  CopG family transcriptional regulator  72.94 
 
 		 90 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.901295  normal  0.042561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0036  transcriptional regulator, CopG family  53.57 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3045  hypothetical protein  52.63 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2781  hypothetical protein  53.95 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0479  CopG family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4874  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62267  hitchhiker  0.00867489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4792  transcriptional regulator, CopG family  36.99 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0584  hypothetical protein  32.94 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00104491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  34.72 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>