27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0043 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  50 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 94 aa  90.1  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0926  CopG family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  40.45 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  42.05 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3354  CopG family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.010277  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  37.23 
 
 		 96 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2575  CopG family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.888914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  33.68 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1216  hypothetical protein  38.55 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.676541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0112  hypothetical protein  38.55 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  51.72 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  31.87 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  34.52 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0805  hypothetical protein  34.94 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  32.53 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  40.48 
 
 		 256 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2369  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.92 
 
 		 1323 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.557702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2268  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.92 
 
 		 1323 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2037  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  34.92 
 
 		 1323 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.851494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>