23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2575 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2575  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  200  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.888914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 100 aa  98.2  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 94 aa  97.8  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  51.14 
 
 		 92 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0926  CopG family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 92 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  42.05 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3354  CopG family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.010277  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  36.26 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  37.08 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  51.67 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  36.96 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  34.83 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1216  hypothetical protein  36.9 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.676541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0112  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  36.05 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  33.73 
 
 		 256 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>