46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3636 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  98.8 
 
 		 415 aa  835    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  89.88 
 
 		 415 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  91.57 
 
 		 415 aa  753    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  91.57 
 
 		 415 aa  753    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  91.57 
 
 		 415 aa  753    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  93.49 
 
 		 415 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  75.18 
 
 		 415 aa  607  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  64.99 
 
 		 418 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  45.08 
 
 		 419 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  40.34 
 
 		 580 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  41.81 
 
 		 580 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  40.79 
 
 		 580 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  39.66 
 
 		 563 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  39.28 
 
 		 563 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  37.02 
 
 		 576 aa  253  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  34.56 
 
 		 652 aa  227  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  31.71 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  29.45 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  32.61 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  31.95 
 
 		 401 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  31.22 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  32.21 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  32.6 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  31.77 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  30.9 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  31.87 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  30.66 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  30.66 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  31.16 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  33.58 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  32.11 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  34.29 
 
 		 392 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  30.98 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  30.83 
 
 		 394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  31.39 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  27.45 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  29.7 
 
 		 409 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  28.01 
 
 		 599 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  28.33 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  25.24 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  28.71 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  27.88 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  25.19 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  27.76 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>