32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0314 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  100 
 
 
295 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  93.44 
 
 
244 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  92.62 
 
 
244 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3898  putative lipoprotein  68.67 
 
 
291 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5833  putative lipoprotein  68.67 
 
 
291 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.077855  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4470  putative lipoprotein  68.67 
 
 
291 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  60.67 
 
 
413 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  52.58 
 
 
570 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.67 
 
 
436 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  45.12 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  39.77 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  38.55 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  41.33 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3268  hypothetical protein  44.3 
 
 
125 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  37.5 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  39.51 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  36.56 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  38.27 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  39.44 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  46.67 
 
 
214 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  39.13 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  54.76 
 
 
100 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  36.99 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  36.99 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  36.99 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  34.82 
 
 
497 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  39.44 
 
 
225 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  31.52 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  33.8 
 
 
231 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  46.43 
 
 
227 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  32.91 
 
 
254 aa  42.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>